DETEKSI MUTASI INDEL 61 bp PADA INTRON 6 GEN RIN2 DAN PENGARUHNYA TERHADAP UKURAN TUBUH AYAM MIRAH

Abstract

Ayam Dayok Mirah adalah ayam lokal asli yang berasal dari Daerah Simalungun. Ayam ini merupakan ayam yang menjadi symbol kebesaran dan disajikan sebagai makanan raja atau panglima perang yang disebut “Dayok Nabinatur”. Ayam ini dipelihara secara khusus dan sudah diisolasi dari ayam kampung lainnya sejak lama. Kajian terhadap keragaman genetic ayam dayok mirah masih belum banyak dilakukan. Gen RIN2 merupakan salah satu gen pada ayam yang berkaitan dengan lemak karkas pada ayam. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keragaman genetic Gen RIN2 pada ayam dayok mirah serta assosiasinya dengan ukuran tubuh dayok mirah. Sampel darah ayam dayok mirah diambil dari peternakan ayam yang berada di Tiga Panah, sebanyak 51 sampel sebanyak 1 cc per ekor ayam. Darah yang sudah diambil dimurnikan kemudian diamplifikasi dan dianalisa di Laboratorium Genomik BRIN. Penelitian ini menemukan terjadinya mutase indel 61 bp RIN2 berada di kromosom 3 pada kromosom tubuh yang terletak pada intron 6, dan menunjukkan ada tiga genotip yang diamati yaitu II, DD, ID. Asosiasi keragaman genetik menunjukkan bahwa gen RIN2 berpengaruh nyata (P<0.05) terhadap panjang paha atas ayam Mirah. Dimana, panjang paha atas dari genotip II lebih besar dibandingkan dengan genotip DD dan ID. Penelitian ini menunjukkan bahwa indel 61 bp berkaitan erat dengan ukuran tubuh panjang paha atas ayam Mirah. Gen RIN2 memiliki potensi untuk digunakan sebagai marka genetic untuk memperbaiki performans pada ayam Mirah. Sehingga gen RIN2 dapat digunakan untuk seleksi molekuler pada ayam Mirah.